公元36年，光武帝亲率大军攻打蜀郡，公孙述在激战中身受重伤，不久后逝世，蜀地最终纳入东汉版图，长期的分裂混战局面至此结束。马援在整个统一中原的过程中起到了举足轻重的作用，尽管他功勋显赫，但从不骄傲自满，对待下属和奴仆始终保持谦逊和蔼的态度，他还鼓励下属监督自己的工作，因此在朝中口碑极佳，声望极高，加之其智勇双全，自然深受光武帝的赏识与重用。
公元41年，交趾郡爆发叛乱，马援主动请缨出征。至公元43年，马援率军成功平定了交趾叛乱，大量叛军被斩杀，俘虏众多，并击杀叛军首领。捷报传至洛阳，光武帝册封马援为新息侯，赠送大量财物，并发放赏金予士兵。待马援率大军凯旋，光武帝又特意赏赐他一辆精致的战车。
公元47年，武陵（今湖南常德西部）地区的五溪蛮部落起兵反叛东汉。此时马援已年逾六旬，光武帝本想找他人领军出征，但马援得知消息后，身披全副铠甲，疾步闯入大殿，坚毅地站在皇帝面前表示：“老臣仍有余力率军征战，男儿志在四方，恳请皇帝允准我为国家做出最后的贡献。”马援虽已年迈，但全副武装的他丝毫不见衰老痕迹，光武帝再次对他的决心表示赞赏，遂批准了他的请战要求。
马援不负所托，再次凯旋归来，然而在返程途中不幸染疾，不久便去世了。作为东汉的开国功臣之一，马援的一生几乎是在战场上度过，他以满腔热血为国效力，其事迹值得后世敬仰和学习。马援步入东汉朝廷，全凭自身才华和实力，他未曾依赖他人举荐，也鄙视阿谀奉承，依靠真才实干步步高升；即便位居高位，他仍然保持着平易近人的作风，实属难得。
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